===== Problèmes et méthodes algorithmiques en bioinformatique =====


^ Enseignant ^ Site/Liens ^ Cours ^ TD ^ TP ^ ECTS ^
| M. Christian Michel |  | 24 | 12 |  |  |
^ Objectifs ^^^^^^
| Ce cours présente les principaux problèmes et méthodes algorithmiques en bioinformatique. ||||||
^ Contenu ^^^^^^
| Méthodes statistiques de recherche de motifs biologiques: \\  * fréquences d'occurrence et significativité,\\  * fonctions de corrélation et ses transformées,\\  * entropie,\\  * méthodes graphiques (exemple avec la représentation "Chaos Game"),\\  * méthodes statistiques multidimensionnelles (exemple avec l'Analyse en Composantes Principales).  ||||||
| Modèles d’évolution des gènes par simulation informatique.  ||||||
| Modèles probabilistes d’évolution des gènes (lettres et extension aux mots).  ||||||
| Matrices de mutation.  ||||||
| Distances phylogénétiques.  ||||||
| Codes: maximal, auto-complémentaire, comma-free, circulaire, génétique.  ||||||
| Présentation des principaux résultats de recherche obtenus par l'équipe de bioinformatique. ||||||
^ Prérequis ^^^^^^
| Néant. ||||||
^ Références ^^^^^^
|  ||||||
^ Contrôle des Connaissances ^^^^^^
| Contrôle continu : coeff. 1/3 [[bioinfo_projet|]] ||||||
| Examen écrit : coeff. 2/3 (durée : 2h) ||||||

==== Notes ====

  * [[bioinfo_1|]]
  * [[bioinfo_2|]]
  * [[bioinfo_3|]]
  * [[bioinfo_4|]]
  * [[bioinfo_5|]]
  * [[bioinfo_6|]]